胃で消化された食べ物は栄養を吸収するために小腸に送られます。 しかし、胃で強い酸をあびた食べ物がそのまま小腸に入ると小腸が溶けてしまいます。 十二指腸では胃を出た食べ物にアルカリ性の液「膵液」を吹きつけて、あっという間に中和します。 膵液には多くの消化酵素が含まれていて、消化を助けるはたらきもあります。
食べ物は，口からこう門までの消化管を通るうちに養分に 変化し，主に小腸で養分や水分が吸収される。
水分は小腸で主に吸収されるのですが、水だけのほうが栄養のあるスポーツ飲料よりも胃に溜まらずすぐに小腸に流れ込むことが知られており、これも水やお茶が有利な根拠とされています。
吸収された養分は毛細血管などに入り、全身の細胞に運ばれます。 小腸では３時間から15時間かけて、ゆっくり消化・吸収が行われます。 養分を吸収された、食べたものの残りは、大腸へと運ばれます。
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